Ο Γιάννης Παναγούλιας, γιος του Αλκετα Παναγούλια, άφησε την τελευταία του πνοή, σε ηλικία 55 ετών, στον ύπνο του, χωρίς να αντιμετωπίζει πρόβλημα με την υγεία του.
Ειδικότερα, 11 χρόνια μετά από τον θάνατο του Αλκέτα Παναγούλια, η οικογένεια βυθίστηκε ξανά στο πένθος, με την απώλεια του γιου του, ο οποίος διέμενε στην Βιρτζίνια των Ηνωμένων Πολιτειών.
Αξίζει να σημειωθεί ότι ο Γιάννης ήταν μαζί με την αδερφή του, Δέσποινα, τα δύο παιδιά του προπονητή, ο οποίος έχει συνδέσει το όνομά του με δύο γεγονότα-σταθμούς στην ιστορία της Εθνικής Ελλάδας, την πρώτη της συμμετοχή σε τελική φάση Ευρωπαϊκού Πρωταθλήματος (1980) και την παρθενική παρουσία της σε τελικά Παγκοσμίου Κυπέλλου (1994).
Επίσης, το όνομά του έχει συνδεθεί με τον Άρη, τη μοναδική ελληνική ομάδα στην οποία αγωνίστηκε, από το 1951 μέχρι το 1962, ενώ είχε διατελέσει- μεταξύ άλλων- προπονητής σε Ολυμπιακό, Άρη, Ηρακλή και Λεβαδειακό.